A délelőttinél kellemesebb körülmények fogadták a MotoGP szereplőit a Cseh Nagydíj második szabadedzésén. Ennek ellenére a köridők sokáig elmaradtak az első tréningen látottaktól: Andrea Iannone, Valentino Rossi és Maverick Vinales is hiába ostromolta a ducatis olasz eredményét. Ők hárman harcoltak egyébként az első helyért, s még Jorge Lorenzo is oda tudott férkőzni az élmezőnybe, a vb-éllovas Marc Marquez ellenben egy óriási mentéssel hívta fel magára a figyelmet.
A gyakorlás közepén a legtöbben hosszabb etapokat teljesítettek, hogy felmérjék a gumikopás mértékét és a versenytempójukat, a hajrához közeledve azonban ismét záporozni kezdtek a gyorskörök. Elsőként Andrea Dovizioso törte meg a csendet, de az olasz nem sokáig vezetett, Lorenzo ugyanis nála is erősebb időt ért el – sőt, a címvédő a második nekifutására végre a hétvége legjobb eredményét érte el, elsőként jutva 1:56-on belülre.
A fináléban aztán Marqueznek jött ki a legjobban a lépés, így a hondás zsebelte be az edzéselsőséget. A fiatal spanyol mögé Iannone zárkózott fel másodiknak, megelőzve Lorenzót és a Dani Pedrosa szélárnyékát a tőle megszokott módon remekül kihasználó Hector Barberát. Rossinak végül be kellett érnie az ötödik helyezéssel, míg a top10-be Dovizioso, Aleix Espargaro, Smith, Vinales és Pedrosa fért még be. Folytatás szombat délelőtt a harmadik edzéssel.
A 2. szabadedzés végeredménye:
| 1. | Marc MARQUEZ | SPA | Repsol Honda Team | Honda | 1'55.840 | |
| 2. | Andrea IANNONE | ITA | Ducati Team | Ducati | 1'55.944 | 0.104 / 0.104 |
| 3. | Jorge LORENZO | SPA | Movistar Yamaha MotoGP | Yamaha | 1'55.977 | 0.137 / 0.033 |
| 4. | Hector BARBERA | SPA | Avintia Racing | Ducati | 1'56.124 | 0.284 / 0.147 |
| 5. | Valentino ROSSI | ITA | Movistar Yamaha MotoGP | Yamaha | 1'56.174 | 0.334 / 0.050 |
| 6. | Andrea DOVIZIOSO | ITA | Ducati Team | Ducati | 1'56.235 | 0.395 / 0.061 |
| 7. | Aleix ESPARGARO | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 1'56.441 | 0.601 / 0.206 |
| 8. | Bradley SMITH | GBR | Monster Yamaha Tech 3 | Yamaha | 1'56.494 | 0.654 / 0.053 |
| 9. | Maverick VIÑALES | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 1'56.615 | 0.775 / 0.121 |
| 10. | Dani PEDROSA | SPA | Repsol Honda Team | Honda | 1'56.662 | 0.822 / 0.047 |
| 11. | Cal CRUTCHLOW | GBR | LCR Honda | Honda | 1'56.837 | 0.997 / 0.175 |
| 12. | Loris BAZ | FRA | Avintia Racing | Ducati | 1'56.957 | 1.117 / 0.120 |
| 13. | Danilo PETRUCCI | ITA | OCTO Pramac Yakhnich | Ducati | 1'57.052 | 1.212 / 0.095 |
| 14. | Scott REDDING | GBR | OCTO Pramac Yakhnich | Ducati | 1'57.090 | 1.250 / 0.038 |
| 15. | Pol ESPARGARO | SPA | Monster Yamaha Tech 3 | Yamaha | 1'57.335 | 1.495 / 0.245 |
| 16. | Eugene LAVERTY | IRL | Pull & Bear Aspar Team | Ducati | 1'57.336 | 1.496 / 0.001 |
| 17. | Stefan BRADL | GER | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 1'57.471 | 1.631 / 0.135 |
| 18. | Alvaro BAUTISTA | SPA | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 1'57.569 | 1.729 / 0.098 |
| 19. | Yonny HERNANDEZ | COL | Pull & Bear Aspar Team | Ducati | 1'57.724 | 1.884 / 0.155 |
| 20. | Tito RABAT | SPA | Estrella Galicia 0,0 Marc VDS | Honda | 1'58.054 | 2.214 / 0.330 |
