Mindössze tíz perccel az Andrea Iannone elsőségével zárult, tét nélküli negyedik edzés után máris kezdetét vette a kvalifikáció első szakasza a Sachsenringen. A legnagyobb név az indulók között egyértelműen Jorge Lorenzo volt, aki a jelenlegi szisztéma bevezetése óta először volt kénytelen a Q1-ben is pályára gurulni. A hétvége eddigi részében meglepően gyenge teljesítményt nyújtó yamahás második gyorskörével már az élre állt, ám első helyét nem tudta megőrizni az etap végéig, Danilo Petrucci ugyanis 25 ezreddel gyorsabbnak bizonyult nála.
A címvédő ráadásul az utolsó percben egy bukást is elkönyvelhetett, ám ennek ellenére is bejutott a második szakaszba – igaz, csak néhány századdal utasította maga mögé Cal Crutchlow-t, aki többek között Bradley Smith-hez, Scott Reddinghez és az asseni győztes Jack Millerhez hasonlóan kiesett.
A Q2-ben aztán már a legjobbak is pályára hajtottak, hogy eldöntsék egymás között a legelőkelőbb rajthelyek sorsát. Az egyik esélyesnek számító Andrea Iannone rögtön egy kicsúszással indított, Hector Barbera ellenben az élre állt, kihasználva az előtte haladó Marc Marquez szélárnyékát is – igaz, következő nekifutásra már a repsolos érte el a jobb időt, míg kettejük mögött Valentino Rossi állt a harmadik helyen féltávnál.
A fináléhoz közeledve aztán megtörtént az, amire végképp nem számíthattunk: Lorenzo szűk fél órán belül másodszor – a hétvége során pedig harmadszor – is elesett! A pole-ért eközben senki nem tudta igazán megszorongatni Marquezt, így a vb-éllovas idei negyedik rajtelsőségét szerezte. A második helyet az ismét mögötte szélárnyékozó Barbera kaparintotta meg, míg az első sort Rossi teszi majd teljessé vasárnap. A másodikba a „Doktorral” ezredre azonos időt elérő Petrucci, valamint Pol Espargaro és Vinales sorakozhat majd fel, míg a top10-et Dovizioso, Aleix Espargaro, Iannone és Pedrosa teszi teljessé. A borzalmas kvalifikációt maga mögött tudó Lorenzónak mindössze a 11. hely jutott: a címvédő csak Hernandezt tudta maga mögé utasítani.
Az időmérő edzés összesített végeredménye:
| 1. | Marc MARQUEZ | SPA | Repsol Honda Team | Honda | 1'21.160 | |
| 2. | Hector BARBERA | SPA | Avintia Racing | Ducati | 1'21.572 | 0.412 / 0.412 |
| 3. | Valentino ROSSI | ITA | Movistar Yamaha MotoGP | Yamaha | 1'21.666 | 0.506 / 0.094 |
| 4. | Danilo PETRUCCI | ITA | OCTO Pramac Yakhnich | Ducati | 1'21.666 | 0.506 |
| 5. | Pol ESPARGARO | SPA | Monster Yamaha Tech 3 | Yamaha | 1'21.738 | 0.578 / 0.072 |
| 6. | Maverick VIÑALES | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 1'21.784 | 0.624 / 0.046 |
| 7. | Andrea DOVIZIOSO | ITA | Ducati Team | Ducati | 1'21.858 | 0.698 / 0.074 |
| 8. | Aleix ESPARGARO | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 1'21.883 | 0.723 / 0.025 |
| 9. | Andrea IANNONE | ITA | Ducati Team | Ducati | 1'21.890 | 0.730 / 0.007 |
| 10. | Dani PEDROSA | SPA | Repsol Honda Team | Honda | 1'21.892 | 0.732 / 0.002 |
| 11. | Jorge LORENZO | SPA | Movistar Yamaha MotoGP | Yamaha | 1'22.088 | 0.928 / 0.196 |
| 12. | Yonny HERNANDEZ | COL | Pull & Bear Aspar Team | Ducati | 1'22.346 | 1.186 / 0.258 |
| Kiesett a Q1-ben: | ||||||
| 13. | Cal CRUTCHLOW | GBR | LCR Honda | Honda | 1'21.783 | |
| 14. | Bradley SMITH | GBR | Monster Yamaha Tech 3 | Yamaha | 1'21.994 | |
| 15. | Scott REDDING | GBR | OCTO Pramac Yakhnich | Ducati | 1'22.236 | |
| 16. | Jack MILLER | AUS | Estrella Galicia 0,0 Marc VDS | Honda | 1'22.382 | |
| 17. | Stefan BRADL | GER | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 1'22.493 | |
| 18. | Eugene LAVERTY | IRL | Pull & Bear Aspar Ducati Team | Ducati | 1'22.567 | |
| 19. | Alvaro BAUTISTA | SPA | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 1'22.670 | |
| 20. | Loris BAZ | FRA | Avintia Racing | Ducati | 1'22.860 | |
| 21. | Tito RABAT | SPA | Estrella Galicia 0,0 Marc VDS | Honda | 1'23.075 | |
